DNA提取
(一)培养细胞DNA提取
1、原理
细胞裂解液中含有去污剂十二烷基硫酸钠(SDS),溶解细胞膜、核膜,破坏细胞并释放出来DNA。蛋白酶K是光谱蛋白酶,能在SDS和EDTA存在下保持高活性。SDS破坏细胞,并将组氨酸从组蛋白分子中拆下,而EDTA能抑制DNase的活性,蛋白酶K将所有蛋白降解成为肽或小片段氨基酸,遂使DNA分子能完整的被分离出来,再用RNase去掉RNA、通过酚/氯仿反复抽提获得纯净DNA。
2、试剂
PBS缓冲液、细胞裂解液、蛋白酶K溶液、tris饱和酚、氯仿、TE缓冲液、RNaseA 、3M醋酸钠(PH 7.4)、乙醇等。
3、破碎细胞、释放核酸(一)
(1)取对数生长期细胞,1×106~109个细胞。
(2)弃上清液,PBS液冲洗2次。
(3)加入约250ul细胞裂解液,缓慢混匀。
(4)37℃孵育20min。
(5)加入适量蛋白酶K(终浓度达到100ug/ml),混匀。
(6)55℃,水浴1H。
(7)加入150ulTris饱和酚(PH8.0),混匀。
(8)加入等体积(150ul)氯仿,轻柔混匀1min。
(9)12000rpm,室温,离心10min。
(10)上清液移至一个新的1.5ml离心管中。
(11)重复(7)~(10)2~3次,直至离心后液面间没有蛋白。
(12)加入250ul氯仿,轻柔混匀1min,弃上清液。
(13)12000rpm,室温,离心10min,弃上清液。
(14)加入0.1×体积3mol/L NaAc(pH 5.2),混匀。
(15)加入2.2×体积-20℃预冷的无水乙醇,混匀。
(16)-20℃,放置30min或过夜。
(17)12000rpm,室温,离心10min。
(18)弃上清液,加入1ml预冷的70%乙醇洗涤2min。
(19)12000rpm,室温,离心10min。
(20)弃上清液,将残留尽量吸干。
(21)室温,晾晒。
(22)用适量TE或去离子水溶解DNA。定量、标记后-20℃保存。