质粒DNA的制备
【实验目的】
熟悉质粒DNA常用的制备方法
【实验原理】
转化细胞中的质粒DNA制备主要包括三个步骤:细菌的培养、收获和裂解、质粒的分离和纯化。低浓度的碱和SDS可以有效地裂解细菌的细胞壁,从而使质粒释放出来。
【实验试剂与器材】
1. 细胞悬浮液: 50mM葡萄糖,25mM Tris.Cl,( pH8.0),10mM EDTA.Na2,(pH8.0)
2. 细菌裂解液: 0.2mol/L NaOH,1% SDS
3. 中和液: 60ml 5M醋酸钾,11.5ml 冰醋酸,28.5ml双蒸水
4. 3mol/L NaAc (pH 5.2)
5. TE饱和酚 (pH8.0)
6. 氯仿/异戊醇 = 24:1
7. RNase(20mg/ml)
【实验方法与步骤】
(一)质粒的小量制备:
1. 将5ml LB培养液(含筛选抗生素)加入到容量为15ml并通气良好的试管中,然后将转化菌的一个单菌落接种于培养液中,37℃以225rpm速度振荡培养14-16h;
2. 10,000rpm,4℃离心5min,弃培养液;
3. 用预冷的细胞悬浮液将菌体悬浮起来,室温放置5min;
4. 加入细菌裂解液,上下颠倒微量离心管以裂解细菌,待溶液变黏稠为止;
5. 加入中和液,上下颠倒混合后置冰上5min,12,000rpm,4℃离心5min;
6. 将上清移至另一离心管中(注意不要混入白色沉淀物),加入等体积的TE饱和酚/ 氯仿(1:1)混合液,振荡混匀1min,12,000rpm离心2min;
7. 将上层水相移至另一离心管中,加入等体积的氯仿/异戊醇(24:1)溶液,振荡混匀1min,12,000rpm离心2min;
8. 将上层水相移至另一离心管中,加入2.5倍体积的无水乙醇,置-20℃沉淀15-30min,然后12,000 rpm离心15min;
9. 弃上清,于沉淀中加入100?滋L双蒸水或TE(pH8.0)溶解沉淀,加入20?滋g/ml RNase,置室温30min,然后加入等体积的氯仿/异戊醇(24:1),振荡混匀1min,12,000rpm离心2min,将上层水相移至另一离心管中,加入0.1倍体积3M NaAc(pH5.2)和2.5倍体积无水乙醇,置-20℃沉淀15~30min,然后离心15min;
10. 弃上清,加入70%乙醇( 注意不要混合),12000rpm离心10min;
11. 弃上清,真空干燥或自然干燥质粒DNA;
12. 用去离子水溶解质粒DNA,-20℃保存备用。
(二)质粒的大量制备:
1. 将5ml转化菌种接种于500ml LB培养液(含用于筛选的抗生素)中,37℃以225rpm速度振荡培养12~16小时;
2. 10,000rpm,4℃离心15min收集菌体;
3.将细菌悬浮于100ml预冷的STE(0.1M NaCl,10mM Tris.Cl,pH8.0,1mM EDTA,pH8.0)中,12,000rpm离心收集菌体;
4. 将菌体悬于10ml细菌悬浮液中,再移至50ml离心管中;
5. 加入1ml用10mM Tris.Cl (pH 8.0)新鲜配制的溶菌酶溶液(10mg/ml),混合后室温孵育30min;
6. 加入15ml新鲜配制的细胞裂解液,上下颠倒混合直至溶液变黏稠为止;
7. 加入10ml预冷的中和液,上下颠倒混匀,冰浴10min;
8. 12,000rpm,4℃离心20min;
9. 将上清通过四层消毒纱布滤入另一50ml离心管中,加入0.6倍体积的异丙醇,室温放置10min,12,000rpm,室温离心5min;
10. 弃上清,于沉淀中加入水和RNase,置室温30min,然后用氯仿/异戊醇(24:1)抽提一次,于上层水相中加入0.1倍体积3M NaAC(pH5.2)和2.5倍体积无水乙醇,-20℃ 沉淀15min,12,000rpm离心15min;
11. 弃上清,用75%乙醇室温洗一次,12,000rpm,离心10min;
12. 弃上清,真空干燥或自然干燥质粒DNA;
13. 加适量去离子水或TE缓冲液(pH8.0)溶解质粒DNA,-20℃保存备用。