GST融合蛋白表达和纯化
点击次数: 更新时间:2016/11/17 10:54:00
表达GST融合蛋白
载体
pGEX-KG 大小:5006bp,氨苄青霉素抗性(Ampr),IPTG诱导表达
酶切位点:BamHI 930、SmaI 937、EcoRI 962、XbaI 966、NcoI 974、SalI 980、XhoI 985、SacI 992、HindIII 994
构建pGEX-KG-YFG重组质粒
1、分析所感兴趣的基因(your favorite GENE, YFG)
Primer Premier 5.0软件,分析YFG含有哪些酶切位点,注意是否与pGEX-KG载体的多克隆位点有重合
2、确定合适的双酶切位点
对照YFG、载体多克隆位点,确定上、下游酶切位点
3、设计PCR上、下游引物
Primer Premier 5.0软件,设计PCR上、下游引物
酶切位点外最多含6个碱基
3’端不是A,最好是G或C,但是不推荐使用GC或CG结尾
3’端至少保证有10个碱基完全配对
得分(Rating)大于70
[注意]
上游引物:是否添加适当碱基,确保不打乱开放阅读框
下游引物:添加终止密码子(UAA、UAG、UGA)
4、引物合成及保存
纯化方法:柱层析or聚丙烯酰胺凝胶电泳
保存:贮存浓度:100pmol/μl(100μM),工作浓度:10pmol/μl(10μM),-20°C保存
5、PCR扩增YFG
模板:质粒10ng/μl 稀释少量 -20°C保存 引物:10pmol/μl(10μM) -20°C保存
Taq酶:NEB Quick-Load Taq 2×Master Mix 扩增片段小于2.0kb
反应体系(配制时置于冰上)
反应条件
(1) 预变性 94°C 5 min
(2) 变性 94°C 30 s
(3) 退火 待定 30 s
(4) 延伸 72°C 待定
(5) 重复2-5 25-30个循环
(6) 补平缺口 72°C 10 min
(7) 暂存 10°C
[注意]
退火温度:参考4(G+C)+2(A+T)-4(互补碱基),参考Ta Opt(Primer Premier 5.0)
延伸时间:Taq酶:1kb/min
循环数小于30,减少错配
琼脂糖电泳检测PCR产物
0.8%有效分离范围:10~0.8kb;1.0%有效分离浓度7~0.5kb
50ml TAE加入5μl EB母液(5mg/ml)
100V,30-45min
拍照或者紫外灯下切胶回收
6、构建pGEX-KG-YFG
酶切:双酶切PCR产物、pGEX-KG
回收:PCR产物直接回收、pGEX-KG电泳之后切胶回收
连接:pGEX-KG 50ng、插入片段150ng
转化铺平板:Ampr
挑单克隆:Ampr
鉴定:小提质粒酶切 or菌体 PCR
7、转化BL21(DE3)pLysS菌株 检测GST融合蛋白表达
(1)冰上融化BL21(DE3)pLysS感受态细胞(天根)
(2)2 ml离心管中,加入25μl BL21+ 3μl质粒(300-500ng),混匀(质粒≤感受态1/10)
(3) 冰上放置30min
(4)42°C,90s
(5) 冰上放置2-3min
(6)加入300μl LB(无抗生素)(相当于菌体10倍体积的LB),37°C,250rpm,1 h
(7)4000rpm,2min,弃上清,其余混匀以后涂平板(Ampr),37°C,过夜(16 h)
(8)挑单克隆菌落,5ml LB(Ampr),37°C,250rpm,过夜(16 h)
(9)稀释10倍、20倍、50倍测定OD600
(10)选择合适的稀释倍数,5ml菌液,37°C,250 rpm,1 h,测定OD600
(11)取100μl菌液加入5ml LB(Ampr)(50倍稀释),37°C,250rpm,过夜(16 h)
(12) 取500μl菌液加入5ml LB(Ampr)(10倍稀释)(其余菌液4°C保存),测OD600
(13)37°C,250 rpm,2 h(OD600:0.6-0.8),测OD600
(14)室温放置20 min(摇床降温,30°C)
(15)取100μl作为诱导前对照,冰上放置
(16)菌液中加入IPTG,终浓度0.5-1 mM
(17)30°C,250 rpm,2 -4h(可做时间梯度),测OD600
(18)取100μl作为诱导后对照,连同诱导前菌液,12000rpm,离心2min,加入50μl 1×SDS上样缓冲液
(19) 取4ml菌液,12000rpm,离心2min,收集到2ml离心管中
(20)加入1ml GST裂解缓冲液重悬菌体
(21)超声破碎细胞:超声20s,间隔10s,共3-5次,超声强度200-300W(冰浴)
(22)超声后菌液换入一个新1.5ml离心管,4°C,12000rpm,离心5min
(23)超声后上清:取25μl上清,加入25μl 2×SDS上样缓冲液(其余上清-80°C保存)
(24)超声后沉淀:沉淀加入1ml GST裂解缓冲液重悬取25μl,加入25μl 2×SDS上样缓冲液(其余沉淀-80°C 保存)
(25)将四个样品煮沸3min,12000rpm,离心5min
(26) 8-10%SDS-PAGE,30μl上样,顺序:诱导前菌体、诱导后菌体、超声后上清、超声后沉淀
(27)考马斯亮蓝染色
[注意]
(1)菌液OD值小于1即可
(2)诱导时间最好做一个梯度,2-6h
(3)诱导温度适当摸索,24°C、30°C
(4)IPTG浓度可做梯度,1mM
(5)超声条件可视实际情况改变,只要使细菌裂解充分即可,即菌液清亮不粘稠
8、测序确认
测序引物:pGEX-3通用引物
测序样品:过夜菌1ml;质粒(浓度大于50ng/μl,10μl)
9、中提质粒(Promega)
10、GST融合蛋白纯化
(1)已经转化的菌液,或者重新转化BL21(DE3)pLysS
(2)活化:取20μl菌液加入11ml LB(Ampr)(500倍稀释),37°C,250rpm,过夜(16 h)
(3)取10ml菌液加入100ml LB(Ampr)(10倍稀释)(剩余菌液4°C保存)
(4)37°C,250 rpm,1 h 10 min-1 h 20 min,OD600 0.6-0.8(OD600小于1.0即可)
(5)取1ml菌液作为诱导前对照,冰上放置
(6) 加入IPTG,终浓度1 mM
(7)30°C,250rpm,诱导适当时间(预实验确定)
(8)取1ml菌液作为诱导后对照,连同诱导前菌液,12000rpm,离心2min,收集菌体,加入100μl 1×SDS上样缓冲液
(9)其余菌液,分为两份,倒入50ml离心管,5000rpm,离心20 min,收集细胞
(10)每管加入8-10ml GST裂解缓冲液重悬菌体,转移小烧杯中(无气泡)
(11)超声破碎细胞:超声3s,间隔10s,40次左右,超声强度200-300W(冰浴)
(12)将超声后菌液转移到50ml离心管中,4°C,13000rpm,离心20-30min
(13)将上清转移到1个50ml离心管中,取出50μl,加入50μl 2×SDS上样缓冲液(其余上清-80°C保存)
(14)将沉淀加入16-20ml GST裂解缓冲液(或PBS)重悬,取出50μl,加入50μl 2×SDS上样缓冲液(其余沉淀-8 0°C保存);
(15)将四个样品煮沸3min,12000rpm,离心5min
(16)8-10%SDS-PAGE检测诱导、超声是否合适,30μl上样,顺序:诱导前菌体、诱导后菌体、超声后上 清、超声后沉淀;
(17)考马斯亮蓝染色
(18)混匀glutathione sepharose beads(4B)(mixed slurry),取200μl加入15ml离心管中(2份)
(19)加入10ml PBS,混匀,3000rpm,离心3min,弃上清
(20)加入超声后上清液,4°C轻柔摇荡60分钟(或过夜)(横放)
(21)4°C,3000rpm,离心3min
(22)10ml GST裂解缓冲液洗涤2次(冰上)
(23)10ml TBS(含5mM MgCl2、1mM DTT)洗涤2次(冰上)
(24)弃上清,加入1倍柱床体积的TBS(含5mM MgCl2、1mM DTT、50%甘油),混匀
(25)取悬液测定蛋白浓度或SDS-PAGE
(26) -20°C保存beads